Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx2P48379 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms