Protein–RNA interactions for Protein: P47878

Igfbp3, Insulin-like growth factor-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igfbp3P47878 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Igfbp3P47878 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Igfbp3P47878 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Igfbp3P47878 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Igfbp3P47878 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Igfbp3P47878 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Igfbp3P47878 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Igfbp3P47878 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Igfbp3P47878 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Igfbp3P47878 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Igfbp3P47878 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Igfbp3P47878 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Igfbp3P47878 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Igfbp3P47878 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Igfbp3P47878 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Igfbp3P47878 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Igfbp3P47878 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Igfbp3P47878 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Igfbp3P47878 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Igfbp3P47878 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Igfbp3P47878 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms