Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrprbP47758 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SrprbP47758 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrprbP47758 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms