Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlx1P43345 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms