Protein–RNA interactions for Protein: P41241

Csk, Tyrosine-protein kinase CSK, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CskP41241 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CskP41241 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CskP41241 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CskP41241 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CskP41241 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CskP41241 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CskP41241 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CskP41241 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CskP41241 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CskP41241 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CskP41241 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CskP41241 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CskP41241 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CskP41241 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CskP41241 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CskP41241 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CskP41241 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CskP41241 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CskP41241 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CskP41241 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CskP41241 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CskP41241 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CskP41241 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CskP41241 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CskP41241 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CskP41241 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CskP41241 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CskP41241 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CskP41241 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CskP41241 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CskP41241 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CskP41241 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CskP41241 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CskP41241 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CskP41241 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CskP41241 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CskP41241 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CskP41241 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CskP41241 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CskP41241 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CskP41241 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CskP41241 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CskP41241 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CskP41241 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CskP41241 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CskP41241 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CskP41241 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CskP41241 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CskP41241 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CskP41241 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CskP41241 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CskP41241 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CskP41241 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CskP41241 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CskP41241 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CskP41241 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CskP41241 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CskP41241 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CskP41241 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CskP41241 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CskP41241 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CskP41241 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CskP41241 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CskP41241 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CskP41241 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CskP41241 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CskP41241 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CskP41241 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CskP41241 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CskP41241 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CskP41241 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CskP41241 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CskP41241 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CskP41241 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CskP41241 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CskP41241 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CskP41241 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CskP41241 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CskP41241 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CskP41241 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CskP41241 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CskP41241 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CskP41241 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CskP41241 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CskP41241 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CskP41241 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CskP41241 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CskP41241 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CskP41241 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CskP41241 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CskP41241 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CskP41241 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CskP41241 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CskP41241 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CskP41241 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CskP41241 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CskP41241 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CskP41241 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CskP41241 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CskP41241 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms