Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LtbP41155 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LtbP41155 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LtbP41155 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LtbP41155 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LtbP41155 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LtbP41155 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LtbP41155 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LtbP41155 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LtbP41155 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LtbP41155 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LtbP41155 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LtbP41155 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
LtbP41155 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LtbP41155 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LtbP41155 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LtbP41155 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LtbP41155 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LtbP41155 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LtbP41155 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LtbP41155 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LtbP41155 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LtbP41155 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LtbP41155 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LtbP41155 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
LtbP41155 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LtbP41155 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LtbP41155 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LtbP41155 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LtbP41155 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LtbP41155 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LtbP41155 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
LtbP41155 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LtbP41155 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LtbP41155 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
LtbP41155 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
LtbP41155 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LtbP41155 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LtbP41155 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LtbP41155 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LtbP41155 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LtbP41155 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LtbP41155 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LtbP41155 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LtbP41155 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LtbP41155 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LtbP41155 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LtbP41155 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LtbP41155 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LtbP41155 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LtbP41155 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LtbP41155 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LtbP41155 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LtbP41155 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LtbP41155 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LtbP41155 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbP41155 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbP41155 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbP41155 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbP41155 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbP41155 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbP41155 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbP41155 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbP41155 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbP41155 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbP41155 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbP41155 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbP41155 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbP41155 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbP41155 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbP41155 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbP41155 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbP41155 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbP41155 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbP41155 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbP41155 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbP41155 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbP41155 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbP41155 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbP41155 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbP41155 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbP41155 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbP41155 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbP41155 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbP41155 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtbP41155 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtbP41155 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtbP41155 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtbP41155 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtbP41155 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtbP41155 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtbP41155 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtbP41155 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtbP41155 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
LtbP41155 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtbP41155 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtbP41155 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtbP41155 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtbP41155 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtbP41155 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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