Protein–RNA interactions for Protein: P38060

Hmgcl, Hydroxymethylglutaryl-CoA lyase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgclP38060 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HmgclP38060 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HmgclP38060 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HmgclP38060 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HmgclP38060 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HmgclP38060 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HmgclP38060 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
HmgclP38060 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HmgclP38060 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HmgclP38060 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HmgclP38060 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HmgclP38060 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HmgclP38060 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HmgclP38060 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HmgclP38060 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HmgclP38060 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HmgclP38060 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HmgclP38060 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HmgclP38060 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HmgclP38060 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HmgclP38060 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HmgclP38060 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HmgclP38060 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HmgclP38060 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HmgclP38060 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HmgclP38060 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HmgclP38060 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HmgclP38060 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HmgclP38060 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HmgclP38060 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HmgclP38060 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HmgclP38060 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HmgclP38060 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HmgclP38060 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HmgclP38060 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HmgclP38060 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HmgclP38060 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HmgclP38060 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HmgclP38060 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HmgclP38060 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HmgclP38060 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HmgclP38060 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HmgclP38060 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HmgclP38060 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HmgclP38060 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HmgclP38060 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HmgclP38060 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HmgclP38060 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HmgclP38060 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HmgclP38060 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HmgclP38060 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HmgclP38060 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HmgclP38060 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HmgclP38060 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HmgclP38060 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HmgclP38060 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HmgclP38060 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HmgclP38060 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HmgclP38060 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HmgclP38060 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HmgclP38060 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HmgclP38060 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HmgclP38060 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HmgclP38060 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HmgclP38060 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HmgclP38060 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HmgclP38060 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HmgclP38060 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HmgclP38060 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HmgclP38060 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HmgclP38060 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HmgclP38060 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HmgclP38060 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HmgclP38060 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HmgclP38060 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HmgclP38060 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HmgclP38060 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HmgclP38060 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HmgclP38060 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HmgclP38060 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HmgclP38060 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HmgclP38060 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
HmgclP38060 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HmgclP38060 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HmgclP38060 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HmgclP38060 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HmgclP38060 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HmgclP38060 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HmgclP38060 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HmgclP38060 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HmgclP38060 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HmgclP38060 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HmgclP38060 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HmgclP38060 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HmgclP38060 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HmgclP38060 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HmgclP38060 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HmgclP38060 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HmgclP38060 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HmgclP38060 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms