Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PpardP35396 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PpardP35396 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PpardP35396 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PpardP35396 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PpardP35396 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PpardP35396 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PpardP35396 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PpardP35396 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PpardP35396 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PpardP35396 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PpardP35396 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PpardP35396 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PpardP35396 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PpardP35396 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PpardP35396 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PpardP35396 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PpardP35396 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PpardP35396 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PpardP35396 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PpardP35396 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PpardP35396 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PpardP35396 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PpardP35396 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PpardP35396 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PpardP35396 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PpardP35396 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PpardP35396 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PpardP35396 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PpardP35396 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PpardP35396 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PpardP35396 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PpardP35396 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PpardP35396 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PpardP35396 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PpardP35396 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PpardP35396 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PpardP35396 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PpardP35396 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PpardP35396 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PpardP35396 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PpardP35396 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PpardP35396 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PpardP35396 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PpardP35396 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PpardP35396 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PpardP35396 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PpardP35396 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PpardP35396 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PpardP35396 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PpardP35396 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PpardP35396 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PpardP35396 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PpardP35396 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PpardP35396 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PpardP35396 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PpardP35396 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PpardP35396 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PpardP35396 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PpardP35396 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PpardP35396 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PpardP35396 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PpardP35396 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PpardP35396 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PpardP35396 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PpardP35396 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PpardP35396 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
PpardP35396 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PpardP35396 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PpardP35396 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PpardP35396 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PpardP35396 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PpardP35396 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PpardP35396 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PpardP35396 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PpardP35396 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PpardP35396 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PpardP35396 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PpardP35396 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PpardP35396 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PpardP35396 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PpardP35396 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PpardP35396 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PpardP35396 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PpardP35396 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PpardP35396 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PpardP35396 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PpardP35396 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PpardP35396 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PpardP35396 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PpardP35396 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PpardP35396 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PpardP35396 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PpardP35396 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PpardP35396 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PpardP35396 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PpardP35396 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PpardP35396 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PpardP35396 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PpardP35396 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms