Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms