Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxc5P32043 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms