Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RxraP28700 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RxraP28700 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RxraP28700 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RxraP28700 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RxraP28700 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RxraP28700 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RxraP28700 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RxraP28700 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RxraP28700 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RxraP28700 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RxraP28700 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RxraP28700 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RxraP28700 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RxraP28700 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RxraP28700 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RxraP28700 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RxraP28700 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RxraP28700 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RxraP28700 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RxraP28700 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RxraP28700 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RxraP28700 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RxraP28700 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RxraP28700 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RxraP28700 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RxraP28700 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RxraP28700 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RxraP28700 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RxraP28700 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RxraP28700 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RxraP28700 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RxraP28700 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RxraP28700 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RxraP28700 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RxraP28700 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RxraP28700 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RxraP28700 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RxraP28700 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RxraP28700 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RxraP28700 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RxraP28700 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RxraP28700 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RxraP28700 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RxraP28700 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RxraP28700 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RxraP28700 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RxraP28700 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RxraP28700 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RxraP28700 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RxraP28700 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RxraP28700 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RxraP28700 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RxraP28700 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RxraP28700 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RxraP28700 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RxraP28700 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RxraP28700 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RxraP28700 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RxraP28700 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RxraP28700 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RxraP28700 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RxraP28700 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RxraP28700 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RxraP28700 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RxraP28700 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RxraP28700 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RxraP28700 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RxraP28700 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RxraP28700 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RxraP28700 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RxraP28700 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RxraP28700 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RxraP28700 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RxraP28700 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RxraP28700 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RxraP28700 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RxraP28700 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RxraP28700 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RxraP28700 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RxraP28700 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RxraP28700 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RxraP28700 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RxraP28700 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RxraP28700 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RxraP28700 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RxraP28700 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RxraP28700 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RxraP28700 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxraP28700 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxraP28700 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxraP28700 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxraP28700 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxraP28700 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxraP28700 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxraP28700 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxraP28700 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxraP28700 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxraP28700 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxraP28700 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
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