Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa2P28309 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa2P28309 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa2P28309 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa2P28309 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa2P28309 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa2P28309 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa2P28309 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa2P28309 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms