Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CftrP26361 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
CftrP26361 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CftrP26361 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CftrP26361 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CftrP26361 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CftrP26361 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CftrP26361 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CftrP26361 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CftrP26361 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CftrP26361 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CftrP26361 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CftrP26361 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CftrP26361 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CftrP26361 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CftrP26361 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CftrP26361 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CftrP26361 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CftrP26361 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CftrP26361 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CftrP26361 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CftrP26361 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CftrP26361 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CftrP26361 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CftrP26361 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CftrP26361 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CftrP26361 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CftrP26361 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CftrP26361 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CftrP26361 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CftrP26361 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CftrP26361 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CftrP26361 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CftrP26361 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CftrP26361 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CftrP26361 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CftrP26361 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CftrP26361 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CftrP26361 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CftrP26361 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CftrP26361 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CftrP26361 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CftrP26361 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CftrP26361 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CftrP26361 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CftrP26361 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CftrP26361 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CftrP26361 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CftrP26361 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CftrP26361 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CftrP26361 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CftrP26361 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CftrP26361 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CftrP26361 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CftrP26361 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CftrP26361 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CftrP26361 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CftrP26361 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CftrP26361 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CftrP26361 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CftrP26361 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CftrP26361 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CftrP26361 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CftrP26361 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CftrP26361 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CftrP26361 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CftrP26361 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CftrP26361 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CftrP26361 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CftrP26361 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CftrP26361 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CftrP26361 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CftrP26361 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CftrP26361 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CftrP26361 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CftrP26361 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CftrP26361 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CftrP26361 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CftrP26361 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CftrP26361 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CftrP26361 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CftrP26361 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CftrP26361 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CftrP26361 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CftrP26361 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CftrP26361 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CftrP26361 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CftrP26361 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CftrP26361 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CftrP26361 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CftrP26361 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CftrP26361 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CftrP26361 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CftrP26361 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CftrP26361 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CftrP26361 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CftrP26361 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CftrP26361 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CftrP26361 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CftrP26361 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms