Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms