Protein–RNA interactions for Protein: P26043

Rdx, Radixin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RdxP26043 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RdxP26043 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RdxP26043 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RdxP26043 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RdxP26043 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RdxP26043 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RdxP26043 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RdxP26043 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RdxP26043 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RdxP26043 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RdxP26043 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RdxP26043 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RdxP26043 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RdxP26043 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RdxP26043 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RdxP26043 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RdxP26043 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RdxP26043 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RdxP26043 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RdxP26043 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RdxP26043 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RdxP26043 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RdxP26043 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RdxP26043 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RdxP26043 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RdxP26043 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RdxP26043 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RdxP26043 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RdxP26043 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RdxP26043 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RdxP26043 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RdxP26043 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RdxP26043 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RdxP26043 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RdxP26043 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RdxP26043 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RdxP26043 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RdxP26043 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RdxP26043 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RdxP26043 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RdxP26043 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RdxP26043 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RdxP26043 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RdxP26043 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RdxP26043 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RdxP26043 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RdxP26043 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RdxP26043 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RdxP26043 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RdxP26043 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RdxP26043 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RdxP26043 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RdxP26043 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RdxP26043 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RdxP26043 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RdxP26043 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RdxP26043 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RdxP26043 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RdxP26043 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RdxP26043 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RdxP26043 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RdxP26043 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RdxP26043 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RdxP26043 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RdxP26043 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RdxP26043 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RdxP26043 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RdxP26043 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RdxP26043 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RdxP26043 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RdxP26043 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RdxP26043 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RdxP26043 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RdxP26043 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RdxP26043 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RdxP26043 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RdxP26043 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RdxP26043 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RdxP26043 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RdxP26043 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RdxP26043 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RdxP26043 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RdxP26043 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RdxP26043 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RdxP26043 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RdxP26043 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RdxP26043 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RdxP26043 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RdxP26043 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RdxP26043 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RdxP26043 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RdxP26043 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RdxP26043 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RdxP26043 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RdxP26043 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RdxP26043 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RdxP26043 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RdxP26043 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RdxP26043 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RdxP26043 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms