Protein–RNA interactions for Protein: P24549

Aldh1a1, Retinal dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a1P24549 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Aldh1a1P24549 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms