Protein–RNA interactions for Protein: P23819

Gria2, Glutamate receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria2P23819 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gria2P23819 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gria2P23819 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gria2P23819 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria2P23819 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria2P23819 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria2P23819 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria2P23819 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gria2P23819 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gria2P23819 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gria2P23819 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gria2P23819 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gria2P23819 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gria2P23819 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gria2P23819 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gria2P23819 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gria2P23819 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gria2P23819 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gria2P23819 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gria2P23819 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gria2P23819 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gria2P23819 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gria2P23819 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gria2P23819 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms