Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Eif3aP23116 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Eif3aP23116 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Eif3aP23116 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Eif3aP23116 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Eif3aP23116 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Eif3aP23116 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms