Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms