Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

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Length 672 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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