Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P20040 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P20040 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P20040 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P20040 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P20040 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P20040 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P20040 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P20040 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P20040 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P20040 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P20040 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P20040 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P20040 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P20040 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P20040 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P20040 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P20040 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P20040 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P20040 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P20040 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P20040 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P20040 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P20040 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P20040 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P20040 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P20040 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P20040 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P20040 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P20040 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P20040 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P20040 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P20040 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P20040 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P20040 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P20040 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P20040 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P20040 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P20040 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P20040 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P20040 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P20040 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P20040 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P20040 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P20040 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P20040 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P20040 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
P20040 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P20040 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P20040 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P20040 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P20040 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P20040 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P20040 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P20040 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P20040 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P20040 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P20040 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P20040 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P20040 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P20040 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P20040 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P20040 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P20040 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P20040 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P20040 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P20040 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
P20040 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P20040 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P20040 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
P20040 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P20040 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P20040 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P20040 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P20040 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P20040 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P20040 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P20040 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P20040 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P20040 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P20040 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P20040 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P20040 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P20040 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P20040 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P20040 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P20040 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P20040 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
P20040 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P20040 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
P20040 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P20040 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P20040 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
P20040 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
P20040 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P20040 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
P20040 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P20040 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
P20040 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P20040 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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