Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NefhP19246 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NefhP19246 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NefhP19246 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NefhP19246 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NefhP19246 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NefhP19246 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NefhP19246 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NefhP19246 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NefhP19246 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NefhP19246 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NefhP19246 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NefhP19246 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NefhP19246 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NefhP19246 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NefhP19246 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NefhP19246 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NefhP19246 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NefhP19246 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NefhP19246 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NefhP19246 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NefhP19246 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NefhP19246 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NefhP19246 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NefhP19246 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NefhP19246 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NefhP19246 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NefhP19246 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NefhP19246 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NefhP19246 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NefhP19246 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NefhP19246 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NefhP19246 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NefhP19246 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NefhP19246 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NefhP19246 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NefhP19246 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NefhP19246 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NefhP19246 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NefhP19246 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NefhP19246 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NefhP19246 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NefhP19246 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NefhP19246 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NefhP19246 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NefhP19246 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NefhP19246 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NefhP19246 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NefhP19246 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NefhP19246 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NefhP19246 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NefhP19246 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NefhP19246 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NefhP19246 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NefhP19246 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NefhP19246 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NefhP19246 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NefhP19246 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NefhP19246 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NefhP19246 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NefhP19246 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NefhP19246 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NefhP19246 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NefhP19246 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NefhP19246 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NefhP19246 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NefhP19246 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NefhP19246 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NefhP19246 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NefhP19246 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NefhP19246 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NefhP19246 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NefhP19246 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NefhP19246 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NefhP19246 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NefhP19246 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NefhP19246 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NefhP19246 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NefhP19246 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NefhP19246 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NefhP19246 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NefhP19246 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NefhP19246 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NefhP19246 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NefhP19246 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NefhP19246 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NefhP19246 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NefhP19246 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NefhP19246 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NefhP19246 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NefhP19246 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
NefhP19246 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NefhP19246 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NefhP19246 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NefhP19246 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NefhP19246 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NefhP19246 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NefhP19246 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NefhP19246 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NefhP19246 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms