Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6ka1P18653 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms