Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata1P17679 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata1P17679 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata1P17679 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata1P17679 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata1P17679 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms