Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrphP15331 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrphP15331 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PrphP15331 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrphP15331 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrphP15331 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrphP15331 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrphP15331 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrphP15331 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrphP15331 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrphP15331 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrphP15331 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrphP15331 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrphP15331 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrphP15331 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrphP15331 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PrphP15331 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrphP15331 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrphP15331 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PrphP15331 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PrphP15331 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrphP15331 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PrphP15331 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrphP15331 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PrphP15331 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrphP15331 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrphP15331 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrphP15331 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrphP15331 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrphP15331 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrphP15331 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrphP15331 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrphP15331 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PrphP15331 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PrphP15331 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PrphP15331 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrphP15331 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrphP15331 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrphP15331 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrphP15331 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrphP15331 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrphP15331 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrphP15331 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrphP15331 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrphP15331 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrphP15331 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrphP15331 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrphP15331 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrphP15331 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrphP15331 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrphP15331 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PrphP15331 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PrphP15331 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PrphP15331 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrphP15331 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrphP15331 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrphP15331 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrphP15331 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrphP15331 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrphP15331 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrphP15331 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrphP15331 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrphP15331 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrphP15331 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrphP15331 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrphP15331 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrphP15331 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrphP15331 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrphP15331 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrphP15331 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrphP15331 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrphP15331 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrphP15331 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PrphP15331 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PrphP15331 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrphP15331 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrphP15331 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PrphP15331 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrphP15331 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PrphP15331 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PrphP15331 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrphP15331 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrphP15331 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrphP15331 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrphP15331 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrphP15331 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrphP15331 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrphP15331 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrphP15331 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrphP15331 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrphP15331 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrphP15331 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrphP15331 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrphP15331 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrphP15331 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrphP15331 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrphP15331 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrphP15331 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrphP15331 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrphP15331 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms