Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms