Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
P10404 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
P10404 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P10404 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P10404 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P10404 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P10404 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P10404 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P10404 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P10404 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P10404 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P10404 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P10404 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P10404 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P10404 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P10404 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P10404 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P10404 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P10404 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P10404 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P10404 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P10404 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P10404 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P10404 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P10404 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P10404 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P10404 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P10404 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P10404 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P10404 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P10404 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P10404 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P10404 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P10404 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P10404 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P10404 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P10404 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P10404 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P10404 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P10404 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P10404 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P10404 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P10404 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P10404 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P10404 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P10404 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P10404 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P10404 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P10404 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P10404 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P10404 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P10404 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P10404 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P10404 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P10404 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P10404 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P10404 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P10404 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P10404 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P10404 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P10404 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P10404 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P10404 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P10404 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P10404 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P10404 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P10404 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P10404 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P10404 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P10404 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P10404 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P10404 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P10404 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P10404 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P10404 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P10404 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P10404 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P10404 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P10404 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P10404 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P10404 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P10404 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P10404 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P10404 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P10404 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P10404 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P10404 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P10404 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P10404 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P10404 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P10404 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P10404 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P10404 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P10404 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P10404 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P10404 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P10404 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P10404 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P10404 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P10404 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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