Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms