Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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PdgfrbP05622 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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PdgfrbP05622 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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PdgfrbP05622 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms