Protein–RNA interactions for Protein: P01653

Ig kappa chain V-V region W3082, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01653 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01653 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01653 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01653 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01653 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01653 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01653 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01653 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01653 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01653 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01653 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01653 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01653 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01653 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01653 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01653 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01653 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01653 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01653 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01653 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01653 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01653 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P01653 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01653 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01653 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P01653 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01653 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01653 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01653 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01653 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01653 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01653 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01653 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01653 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01653 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01653 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01653 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01653 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01653 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01653 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01653 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01653 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01653 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01653 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01653 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01653 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01653 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01653 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01653 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01653 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P01653 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01653 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P01653 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01653 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P01653 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P01653 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01653 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01653 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01653 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01653 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01653 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01653 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01653 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01653 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01653 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01653 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01653 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01653 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01653 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01653 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01653 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01653 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01653 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01653 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01653 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01653 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01653 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01653 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01653 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01653 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01653 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01653 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01653 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01653 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01653 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01653 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01653 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01653 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01653 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01653 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01653 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01653 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01653 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01653 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01653 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01653 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01653 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01653 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01653 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01653 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms