Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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