Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp1O89090 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp1O89090 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp1O89090 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp1O89090 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms