Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms