Protein–RNA interactions for Protein: O88623

Usp2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp2O88623 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp2O88623 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp2O88623 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp2O88623 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp2O88623 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp2O88623 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp2O88623 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp2O88623 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp2O88623 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms