Protein–RNA interactions for Protein: O55236

Rngtt, mRNA-capping enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RngttO55236 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RngttO55236 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RngttO55236 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RngttO55236 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RngttO55236 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RngttO55236 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RngttO55236 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RngttO55236 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RngttO55236 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RngttO55236 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RngttO55236 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RngttO55236 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RngttO55236 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RngttO55236 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RngttO55236 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RngttO55236 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RngttO55236 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RngttO55236 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RngttO55236 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RngttO55236 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RngttO55236 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RngttO55236 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RngttO55236 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RngttO55236 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RngttO55236 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RngttO55236 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RngttO55236 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RngttO55236 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RngttO55236 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RngttO55236 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RngttO55236 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RngttO55236 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RngttO55236 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RngttO55236 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RngttO55236 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RngttO55236 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RngttO55236 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RngttO55236 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RngttO55236 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RngttO55236 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RngttO55236 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RngttO55236 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RngttO55236 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RngttO55236 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RngttO55236 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RngttO55236 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RngttO55236 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RngttO55236 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RngttO55236 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RngttO55236 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RngttO55236 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RngttO55236 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RngttO55236 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RngttO55236 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RngttO55236 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RngttO55236 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RngttO55236 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RngttO55236 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RngttO55236 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RngttO55236 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RngttO55236 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RngttO55236 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RngttO55236 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RngttO55236 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RngttO55236 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RngttO55236 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RngttO55236 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RngttO55236 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RngttO55236 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RngttO55236 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RngttO55236 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RngttO55236 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RngttO55236 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RngttO55236 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RngttO55236 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RngttO55236 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RngttO55236 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RngttO55236 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RngttO55236 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RngttO55236 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RngttO55236 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RngttO55236 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RngttO55236 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RngttO55236 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RngttO55236 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RngttO55236 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RngttO55236 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RngttO55236 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RngttO55236 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RngttO55236 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RngttO55236 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RngttO55236 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RngttO55236 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RngttO55236 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RngttO55236 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RngttO55236 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RngttO55236 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RngttO55236 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RngttO55236 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RngttO55236 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms