Protein–RNA interactions for Protein: O54967

Tnk2, Activated CDC42 kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk2O54967 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnk2O54967 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tnk2O54967 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tnk2O54967 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tnk2O54967 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tnk2O54967 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Tnk2O54967 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Tnk2O54967 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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