Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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Cldn5O54942 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
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Cldn5O54942 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Cldn5O54942 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Cldn5O54942 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Cldn5O54942 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Cldn5O54942 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Cldn5O54942 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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