Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms