Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms