Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms