Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Nedd9O35177 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Nedd9O35177 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Nedd9O35177 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
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Nedd9O35177 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Nedd9O35177 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Nedd9O35177 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Nedd9O35177 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Nedd9O35177 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Nedd9O35177 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Nedd9O35177 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Nedd9O35177 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Nedd9O35177 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms