Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gm3239L7N2D9 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3239L7N2D9 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3239L7N2D9 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3239L7N2D9 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3239L7N2D9 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3239L7N2D9 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gm3239L7N2D9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gm3239L7N2D9 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3239L7N2D9 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3239L7N2D9 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gm3239L7N2D9 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3239L7N2D9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3239L7N2D9 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gm3239L7N2D9 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3239L7N2D9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3239L7N2D9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gm3239L7N2D9 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3239L7N2D9 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gm3239L7N2D9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gm3239L7N2D9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3239L7N2D9 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3239L7N2D9 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3239L7N2D9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3239L7N2D9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gm3239L7N2D9 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Gm3239L7N2D9 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Gm3239L7N2D9 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Gm3239L7N2D9 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Gm3239L7N2D9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Gm3239L7N2D9 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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Gm3239L7N2D9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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