Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3278L7N2D2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3278L7N2D2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3278L7N2D2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3278L7N2D2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3278L7N2D2 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3278L7N2D2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3278L7N2D2 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3278L7N2D2 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3278L7N2D2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3278L7N2D2 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3278L7N2D2 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3278L7N2D2 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3278L7N2D2 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3278L7N2D2 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3278L7N2D2 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3278L7N2D2 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3278L7N2D2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3278L7N2D2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3278L7N2D2 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3278L7N2D2 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3278L7N2D2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms