Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ14

Gm4791, Predicted gene 4791, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4791J3QQ14 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm4791J3QQ14 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms