Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms