Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Top6blJ3QMY9 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Top6blJ3QMY9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Top6blJ3QMY9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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