Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gm11236J3QMS7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm11236J3QMS7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm11236J3QMS7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm11236J3QMS7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gm11236J3QMS7 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gm11236J3QMS7 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gm11236J3QMS7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gm11236J3QMS7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gm11236J3QMS7 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gm11236J3QMS7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gm11236J3QMS7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gm11236J3QMS7 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Gm11236J3QMS7 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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