Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930544D05RikJ3QK56 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms