Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim55G3X8Y1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms