Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Rdh16f1E9Q9P8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Rdh16f1E9Q9P8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Rdh16f1E9Q9P8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Rdh16f1E9Q9P8 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Rdh16f1E9Q9P8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh16f1E9Q9P8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh16f1E9Q9P8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Rdh16f1E9Q9P8 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Rdh16f1E9Q9P8 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Rdh16f1E9Q9P8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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